Hannah Bauer

• Telefon: +41 78 345 67 89
• E-Mail: hannah.bauer@email.com
• Standort: Zürich, Schweiz
• LinkedIn: hannahbauerbioinformatics

Zusammenfassung

Fünf Jahre Erfahrung in der Entwicklung und Implementierung bioinformatischer Pipelines zur Analyse großer genomischer Datensätze, was zu einer 15%igen Effizienzsteigerung bei der Datenverarbeitung führte.

Spezialisiert auf die Anwendung statistischer Methoden und maschinellen Lernens zur Identifizierung von Biomarkern und zur Modellierung komplexer biologischer Systeme.

Nachweisliche Erfolge bei der Zusammenarbeit mit interdisziplinären Teams zur Beschleunigung von Forschungsprojekten und der Veröffentlichung von drei Peer-Review-Artikeln.

Berufserfahrung

Bioinformatikerin, Roche Diagnostics International AG -- Rotkreuz, Schweiz

März 2021 – gegenwärtig

• Entwicklung und Validierung von Bioinformatik-Pipelines für die Sequenzierungsanalyse von Next-Generation-Sequenzierungsdaten (NGS), wodurch die Durchlaufzeit um 20% reduziert wurde.

• Anwendung von Machine-Learning-Algorithmen zur prädiktiven Modellierung von Krankheitsverläufen, was zu einer Genauigkeitsverbesserung von 10% führte.

• Zusammenarbeit mit Biochemikern und Statistikern zur Interpretation komplexer Datensätze und zur Ableitung biologisch relevanter Erkenntnisse.

• Automatisierung von Datenanalyse-Workflows mittels Python und Snakemake, was die Reproduzierbarkeit und Skalierbarkeit erhöhte.

Junior Bioinformatikerin, Novartis Institutes for BioMedical Research -- Basel, Schweiz

Januar 2019 – Februar 2021

• Analyse von RNA-Seq-Daten zur Identifizierung differentiell exprimierter Gene in verschiedenen Krankheitsmodellen, was zur Entdeckung von zwei potenziellen therapeutischen Targets führte.

• Mitarbeit bei der Entwicklung einer Datenbank für genetische Varianten und deren Annotation, die die Datenzugänglichkeit für Forschungsteams verbesserte.

• Erstellung von Visualisierungen und Berichten für interne Forschungsprojekte unter Verwendung von R und ggplot2.

Ausbildung

Eidgenössische Technische Hochschule Zürich (ETH Zürich), M.Sc. in Bioinformatik -- Zürich, Schweiz

September 2016 – September 2018

Universität Bern, B.Sc. in Biochemie -- Bern, Schweiz

September 2013 – Juli 2016

Fähigkeiten

Programmiersprachen & Skripting: Python (Pandas, NumPy, SciPy, Scikit-learn), R (Bioconductor, Tidyverse), Bash, SQL

Bioinformatik-Tools & Datenbanken: BLAST, Bowtie2, STAR, GATK, SAMtools, BEDtools, IGV, UCSC Genome Browser, Ensembl, NCBI

Sequenzierungsanalyse: NGS-Datenanalyse (RNA-Seq, WGS, Exom-Sequenzierung), Variantenanalyse, Genexpressionsanalyse, Metagenomik

Statistische Analyse & maschinelles Lernen: Statistische Modellierung, Hypothesentest, Regressionsanalyse, Klassifikation, Clustering, Deep Learning Grundlagen

Software & Systeme: Linux/Unix, Git, Docker, Snakemake, Jupyter Notebooks, High-Performance Computing (HPC)

Sprachen: Deutsch (Muttersprache), Englisch (Fließend), Französisch (Grundkenntnisse)