Merve Arslan
- Telefon: +90 532 456 78 90
- E-posta: merve.arslan@email.com
- Konum: Istanbul, Turkey
- LinkedIn: mervearslanbioinfo
Özet
Genomik veri analizi ve biyoinformatik algoritmaların geliştirilmesinde 5 yıllık deneyime sahip klinik biyoinformatik uzmanı. Genomik varyantların hastalık ilişkilerini belirleyerek tanı ve tedavi süreçlerine %15 katkı sağlamıştır. Yapay zeka ve makine öğrenimi tekniklerini kullanarak biyolojik veri yorumlama kapasitesini artırmıştır.
İş Deneyimi
Kıdemli Biyoinformatik Uzmanı, Genomik Araştırma Merkezi -- Istanbul, Turkey
Mart 2021 – halen
-
Yeni nesil dizileme (NGS) verilerini analiz ederek nadir hastalıkların teşhisi için biyobelirteçlerin keşfedilmesine liderlik etti, bu sayede tanı süresini %20 azalttı.
-
Genomik varyant filtreleme ve yorumlama için özel Python tabanlı araçlar geliştirdi, analiz verimliliğini %30 artırdı.
-
Klinik genetikçilerle yakın işbirliği içinde çalışarak, hasta veritabanlarını genetik bulgularla entegre etti ve klinik raporlama süreçlerini optimize etti.
Biyoinformatik Analisti, Biyo-Veri Çözümleri A.Ş. -- Istanbul, Turkey
Eylül 2018 – Şubat 2021
-
RNA-Seq ve ChIP-Seq verileri üzerinde farklı ifade analizi ve motif keşfi projelerinde görev aldı.
-
Büyük ölçekli omik veri setleri için veri görselleştirme ve istatistiksel analiz raporları hazırladı.
-
Biyoinformatik boru hatlarının otomasyonuna katkıda bulunarak veri işleme süresini %25 kısalttı.
Eğitim
Boğaziçi Üniversitesi, Biyoinformatik ve Genetik, Yüksek Lisans -- Istanbul, Turkey
Eylül 2016 – Temmuz 2018
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik, Lisans -- Ankara, Turkey
Eylül 2012 – Haziran 2016
Beceriler
Veri Analizi: NGS Veri Analizi (RNA-Seq, WES, WGS), Genomik Varyant Çağrısı ve Analizi, İfade Analizi, Metagenomik Analiz, İstatistiksel Genetik
Programlama ve Yazılımlar: Python (Pandas, NumPy, SciPy, Biopython), R (ggplot2, Bioconductor), Bash, Nextflow, Snakemake, Git, Docker, Galaxy
Veritabanları ve Araçlar: UCSC Genome Browser, Ensembl, NCBI, GnomAD, ClinVar, dbSNP, IGV, ANNOVAR, SnpEff
Makine Öğrenimi: Sınıflandırma, Regresyon, Kümeleme, Derin Öğrenme Temelleri
İşletim Sistemleri: Linux/Unix