由美 佐藤 (Yumi Sato)
- 電話: +81 90 8765 4321
- メール: yumi.sato@email.com
- 所在地: 京都市, 日本
- LinkedIn: yumi-sato-bioinfo
概要
ゲノム、トランスクリプトーム、プロテオームデータ解析において7年以上の経験を持つバイオインフォマティクス科学者。次世代シーケンシング（NGS）データのパイプライン開発と最適化を主導し、疾患メカニズムの解明と新規バイオマーカーの特定に貢献。機械学習アルゴリズムを応用し、薬剤応答予測モデルの精度を20%向上させた実績があります。
職歴
シニアバイオインフォマティクス科学者, タカラバイオ株式会社 -- 京都市, 日本
4月 2020 – 現在
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シングルセルRNAシーケンスデータ解析パイプラインを設計・実装し、細胞株の異質性評価時間を30%短縮。
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大規模オミクスデータセットに対し機械学習モデルを適用し、疾患の早期診断バイオマーカーを複数特定、特許出願に貢献。
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共同研究者との連携を通じて、遺伝子発現データの統合解析を行い、新規治療ターゲット候補を5つ発見。
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バイオインフォマティクスチームのジュニアメンバー3名に対し、データ解析手法とプログラミングスキルに関する指導を実施。
バイオインフォマティクス研究員, 京都大学医学部附属病院 -- 京都市, 日本
9月 2017 – 3月 2020
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臨床試験データとゲノムデータを統合解析し、特定の薬剤に対する患者応答の予測モデルを開発。モデルの予測精度は85%を達成。
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NGSデータ解析の標準操作手順（SOP）を確立し、データ処理の一貫性と再現性を確保。
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研究成果を国際学会で発表し、査読付き科学ジャーナルに2本の論文を共同執筆。
学歴
京都大学, 生命科学研究科 バイオインフォマティクス 博士（理学） -- 京都市, 日本
4月 2014 – 3月 2017
京都大学, 生命科学研究科 バイオインフォマティクス 修士（理学） -- 京都市, 日本
4月 2012 – 3月 2014
京都大学, 理学部 生物科学 学士（理学） -- 京都市, 日本
4月 2008 – 3月 2012
スキル
データ解析・プログラミング: Python (Pandas, NumPy, SciPy, scikit-learn), R (Bioconductor, ggplot2), Bash, Perl, SQL
バイオインフォマティクスツール: GATK, BWA, Samtools, DESeq2, EdgeR, Seurat, CellRanger, Galaxy
オミクスデータ解析: ゲノム解析, トランスクリプトーム解析 (RNA-Seq, scRNA-Seq), プロテオーム解析, エピゲノム解析 (ChIP-Seq), メタゲノム解析
統計解析・機械学習: 多変量解析, 統計モデリング, クラスタリング, 分類 (SVM, Random Forest, Neural Networks), 次元削減 (PCA, t-SNE)
データベース・クラウド: MySQL, PostgreSQL, AWS (S3, EC2, Lambda), Docker, Git
言語: 日本語 (ネイティブ), 英語 (ビジネスレベル)
