Ingrid Larsen

• Telefon: +47 98 76 54 32
• E-post: ingrid.larsen@email.com
• Sted: Oslo, Norway
• LinkedIn: ingrid-larsen-bioinfo

Sammendrag

Fem års erfaring med å utvikle og implementere bioinformatiske verktøy for analyse av store genomiske datasett, med fokus på identifisering av biomarkører og forståelse av sykdomsmekanismer. Har ledet prosjekter som har resultert i publiserte funn og forbedret datahåndteringseffektivitet med 25%.

Ekspertise innen statistisk modellering, maskinlæring og visualisering av komplekse biologiske data, som har bidratt til å akselerere forskningsprosesser og informere beslutningstaking i klinisk og akademisk setting.

Arbeidserfaring

Senior Bioinformatiker, Oslo Universitetssykehus -- Oslo, Norway

Mars 2021 – nåværende

• Ledet utviklingen av en ny algoritme for analyse av RNA-sekvenseringsdata, noe som reduserte behandlingstiden med 30% og forbedret nøyaktigheten i genuttrykksanalyse.

• Ansvarlig for utforming og implementering av bioinformatikk-pipelines for storskala genomisk dataanalyse, inkludert WGS, WES og scRNA-seq.

• Samarbeidet tett med forskere og klinikere for å oversette komplekse bioinformatiske funn til klinisk relevante innsikter, og bidro til 4 publiserte artikler i peer-reviewed tidsskrifter.

• Veiledet junior bioinformatikere i beste praksis for dataanalyse og programvareutvikling.

Bioinformatiker, Senter for Molekylær Biologi og Nevrovitenskap (CMBN), Universitetet i Oslo -- Oslo, Norway

August 2018 – Februar 2021

• Utførte analyse av genekspresjonsdata fra nevrodegenerative sykdommer, og identifiserte potensielle biomarkører med 85% sensitivitet og spesifisitet.

• Utviklet skript i Python og R for automatisering av bioinformatiske arbeidsflyter, noe som økte datahåndteringseffektiviteten med 20%.

• Bidro til design av eksperimenter og statistisk analyseplanlegging for flere forskningsprosjekter.

• Presenterte forskningsresultater på nasjonale og internasjonale konferanser.

Utdanning

Universitetet i Oslo, Ph.D. i Bioinformatikk og Genomikk -- Oslo, Norway

August 2014 – Juni 2018

Universitetet i Oslo, M.Sc. i Molekylærbiologi -- Oslo, Norway

August 2012 – Juni 2014

Ferdigheter

Programmeringsspråk: Python (Pandas, NumPy, SciPy, Biopython), R (ggplot2, Bioconductor), Bash, SQL

Bioinformatikk-verktøy og -teknikker: Next-generation sequencing (NGS) dataanalyse (RNA-seq, scRNA-seq, WGS, WES), Variant Calling, Genomisk annotering, Fylogenetisk analyse, Metagenomikk, Proteomikk, Strukturell bioinformatikk

Statistisk analyse og Maskinlæring: Hypotesetesting, Regresjonsanalyse, Klassifisering, Klyngeanalyse, PCA, Random Forests, SVM, Dyp læring (grunnleggende)

Databaser og Skyplattformer: MySQL, PostgreSQL, MongoDB, AWS (S3, EC2), Google Cloud Platform

Visualisering: ggplot2, Matplotlib, Seaborn, Tableau

Operativsystemer: Linux, macOS, Windows

Språk: Norsk (morsmål), Engelsk (flytende)