Freja Jørgensen
- Telefon: +45 24 12 34 56
- E-mail: freja.jorgensen@email.com
- Placering: Aarhus, Denmark
- LinkedIn: freja-jorgensen-bioinfo
Resumé
Fem års erfaring inden for bioinformatik, med speciale i udvikling og implementering af pipelines til analyse af storskala genomiske data. Har succesfuldt reduceret behandlingstiden for NGS-data med 25% gennem optimering af scripts og automatisering af workflows. Solid baggrund i molekylærbiologi og avanceret programmering til biologiske anvendelser.
Erhvervserfaring
Bioinformatiktekniker
Aarhus, Denmark
Marts 2020 – nuværende
GenomIT ApS
-
Udviklede og vedligeholdt bioinformatik-pipelines til analyse af next-generation sequencing (NGS) data, herunder RNA-seq og WGS.
-
Automatiseret dataforbehandling og kvalitetskontrol af råsekvensdata, hvilket forbedrede datakonsistensen med 15%.
-
Samarbejdede med forskningsteams om at designe eksperimenter og fortolke komplekse genomiske resultater.
-
Implementerede versionskontrol (Git) og containerisering (Docker) for at sikre reproducerbarhed af analyseworkflows.
Junior Bioinformatiktekniker
Aarhus, Denmark
August 2018 – Februar 2020
Biosense Diagnostics A/S
-
Assisterede i udviklingen af bioinformatik-værktøjer til analyse af mikrobiomdata fra kliniske prøver.
-
Udførte statistisk analyse på store datasæt for at identificere signifikante biomarkører.
-
Bidrog til dokumentation af analyseprotokoller og standardprocedurer (SOP'er), hvilket sikrede ISO-overholdelse.
-
Programmerede i Python til at automatisere rutineopgaver og dataudtræk fra databaser.
Uddannelse
Aarhus Universitet
Aarhus, Denmark
September 2016 – Juni 2018
Cand.scient. in Kandidat i Bioinformatik
Aarhus Universitet
Aarhus, Denmark
September 2013 – Juni 2016
BSc in Molekylærbiologi
Færdigheder
Programmeringssprog: Python (Pandas, NumPy, Biopython), R (ggplot2, Bioconductor), Bash, SQL
Bioinformatik Værktøjer: BLAST, Bowtie2, BWA, GATK, samtools, bedtools, VCFtools, Nextflow, Snakemake
Databasesystemer: MySQL, PostgreSQL, MongoDB
Operativsystemer: Linux (Ubuntu, CentOS), macOS, Windows
Cloud & Virtualisering: Docker, Kubernetes (grundlæggende), AWS (S3, EC2)
Molekylærbiologiske Teknikker: NGS (RNA-seq, WGS), PCR, qPCR, Gel-elektroforese
Sprog: Dansk (flydende), Engelsk (flydende)
