Mariana Lima Santos
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- E-mail: mariana.lima.santos@email.com
- Localização: São Paulo, Brazil
- LinkedIn: mariana-lima-santos-bioinfo
Resumo
Três anos de experiência em bioinformática, especializada na análise e interpretação de grandes conjuntos de dados genômicos e transcriptômicos. Habilidade comprovada na implementação de pipelines de análise e otimização de fluxos de trabalho para pesquisa em saúde e biotecnologia, contribuindo para a descoberta de biomarcadores.
Experiência prática com linguagens de programação como Python e R, e plataformas de computação de alto desempenho, resultando em uma redução de 20% no tempo de processamento de dados para projetos de sequenciamento de nova geração (NGS).
Experiência Profissional
Técnica de Bioinformática Sênior, BioSolutions Genômicas S.A. -- São Paulo, Brazil
Março 2022 – presente
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Liderou a análise de dados de sequenciamento de RNA (RNA-seq) para identificar genes diferencialmente expressos em estudos de câncer, resultando em 2 publicações científicas.
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Desenvolveu e validou pipelines de bioinformática para análise de variantes genéticas (SNPs e indels) a partir de dados de Whole Exome Sequencing (WES), aumentando a precisão da detecção em 15%.
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Colaborou com equipes de pesquisa e desenvolvimento para adaptar ferramentas de bioinformática às necessidades específicas de projetos, otimizando o fluxo de trabalho em 25%.
Técnica de Bioinformática Júnior, Instituto de Biotecnologia Aplicada -- São Paulo, Brazil
Janeiro 2021 – Fevereiro 2022
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Realizou controle de qualidade e pré-processamento de dados de sequenciamento de nova geração (NGS) para diversos projetos de pesquisa.
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Assistiu na implementação de scripts em Python para automatizar tarefas repetitivas de análise de dados, reduzindo o tempo gasto em 10 horas semanais.
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Participou da análise de dados de metagenômica, contribuindo para a identificação de perfis microbianos em amostras ambientais.
Formação Acadêmica
Universidade de São Paulo (USP), Bacharelado em Bacharelado em Ciências Biológicas (Ênfase em Genética) -- São Paulo, Brazil
Agosto 2016 – Dezembro 2020
FIOCRUZ - Fundação Oswaldo Cruz, Certificado em Curso de Extensão em Bioinformática Aplicada -- Rio de Janeiro, Brazil
Março 2020 – Julho 2020
Competências
Análise de Dados Genômicos: Sequenciamento de Nova Geração (NGS), RNA-seq, WES, Genômica Comparativa, Análise de Variantes, Metagenômica
Linguagens de Programação e Ferramentas: Python (Biopython, Pandas, NumPy), R (Bioconductor, ggplot2), Bash, SQL, Git, Snakemake
Softwares e Bancos de Dados: BLAST, Bowtie2, BWA, GATK, samtools, bedtools, NCBI, Ensembl, UniProt, UCSC Genome Browser
Sistemas Operacionais: Linux, Windows
Habilidades Adicionais: Estatística Aplicada, Visualização de Dados, Resolução de Problemas, Colaboração Interdisciplinar, Metodologias Ágeis
