Zeynep Arslan
- Telefon: +90 532 456 78 90
- E-posta: zeynep.arslan@email.com
- Konum: Ankara, Turkey
- LinkedIn: zeyneparslanbioinfo
Özet
Genomik veri analizi ve biyolojik veritabanı yönetimi konularında 4 yıllık deneyime sahip bir Biyoinformatik Teknikeri. Yeni nesil dizileme verilerinin işlenmesi, analiz pipeline'larının geliştirilmesi ve biyolojik yorumlama süreçlerinde uzmanlaşmıştır. Farklı projelerde veri kalitesini %15 oranında artıran çözümler geliştirmiştir.
İş Deneyimi
Kıdemli Biyoinformatik Teknikeri, Genomik Araştırma Merkezi -- Ankara, Turkey
Mart 2022 – halen
-
RNA-Seq ve WGS verileri için uçtan uca analiz pipeline'ları tasarladı ve uyguladı, analiz sürelerini %20 azalttı.
-
Büyük ölçekli genomik veri setlerinin depolanması ve yönetimi için MySQL tabanlı veritabanları geliştirdi ve optimize etti.
-
Proje bazlı olarak 10'dan fazla araştırma projesinde veri analizi ve raporlama süreçlerini yönetti, bulguların bilimsel yayınlara dönüştürülmesine katkıda bulundu.
-
Yeni biyoinformatik araçların ve algoritmaların değerlendirilmesinde ve uygulanmasında ekibe liderlik etti.
Biyoinformatik Teknikeri, Biyoteknoloji Enstitüsü -- Ankara, Turkey
Eylül 2020 – Şubat 2022
-
Yeni nesil dizileme (NGS) verilerinin ön işleme, haritalama ve varyant tespiti aşamalarını gerçekleştirdi.
-
Biyolojik veri setleri için istatistiksel analizler ve görselleştirmeler yaparak araştırma ekiplerine destek verdi.
-
Python ve R kullanarak tekrarlanabilir analiz raporları ve otomasyon scriptleri geliştirdi.
-
Biyoistatistiksel yöntemlerin uygulanması konusunda 3 farklı projede aktif rol aldı.
Eğitim
Orta Doğu Teknik Üniversitesi (ODTÜ), Biyolojik Bilimler ve Biyoinformatik, Yüksek Lisans -- Ankara, Turkey
Eylül 2018 – Temmuz 2020
Hacettepe Üniversitesi, Biyoloji, Lisans -- Ankara, Turkey
Eylül 2014 – Haziran 2018
Beceriler
Biyoinformatik Yazılımları ve Araçları: BLAST, Clustal Omega, GATK, SAMtools, Bowtie2, BWA, ANNOVAR, IGV, UCSC Genome Browser
Programlama Dilleri: Python (Biopython, Pandas, NumPy), R (ggplot2, Bioconductor), Bash scripting, SQL
Veri Analizi ve İstatistik: Genomik veri analizi, RNA-Seq analizi, Varyant tespiti, Gen ifadesi analizi, İstatistiksel modelleme, Makine öğrenimi temelleri
Veritabanları: MySQL, PostgreSQL, Veri entegrasyonu ve yönetimi
İşletim Sistemleri: Linux/Unix, Windows
Diğer Beceriler: Yeni nesil dizileme (NGS) teknolojileri, Biyolojik yorumlama, Bilimsel raporlama, Proje yönetimi