Clara Wagner

• Telefon: +49 1517 8901234
• E-Mail: clara.wagner@email.com
• Standort: Hamburg, Deutschland
• LinkedIn: clara-wagner-bioinformatics

Zusammenfassung

Mehr als 5 Jahre Erfahrung in der Bioinformatik, spezialisiert auf die Analyse großer Omics-Datensätze zur Identifizierung von Biomarkern und Krankheitsmechanismen. Erfolgreich bei der Entwicklung und Implementierung von Bioinformatik-Pipelines zur effizienten Verarbeitung und Interpretation genomischer, transkriptomischer und proteomischer Daten. Expertise in der Anwendung statistischer Methoden und maschinellem Lernen zur Lösung komplexer biologischer Fragestellungen.

Berufserfahrung

Bioinformatik-Technikerin, Evotec AG -- Hamburg, Deutschland

März 2021 – gegenwärtig

• Entwicklung und Wartung von Bioinformatik-Pipelines für die Sequenzierungsdatenanalyse (RNA-Seq, scRNA-Seq, WGS) zur Unterstützung von Wirkstoffforschungsprojekten.

• Analyse von Hochdurchsatz-Omics-Daten zur Identifizierung von Zielmolekülen und Biomarkern, was zur Validierung von 3 neuen Kandidaten für präklinische Studien führte.

• Zusammenarbeit mit multidisziplinären Teams zur Interpretation biologischer Ergebnisse und zur Bereitstellung von datengesteuerten Erkenntnissen für die Projektentwicklung.

• Automatisierung von Datenauswertungsprozessen, Reduzierung der Bearbeitungszeit um durchschnittlich 25%.

Junior Bioinformatik-Technikerin, Centogene GmbH -- Rostock, Deutschland

September 2018 – Februar 2021

• Durchführung von Qualitätskontrollen und Vorverarbeitung von Next-Generation-Sequenzierungsdaten (NGS) für die Diagnostik seltener Krankheiten.

• Unterstützung bei der Entwicklung und Implementierung von Algorithmen zur Variantenfiltrierung und -annotation in klinischen Genomik-Pipelines.

• Mitarbeit an der Erstellung von Berichten über genetische Varianten und deren klinische Relevanz für Ärzte und Wissenschaftler.

• Optimierung von Skripten zur Datenextraktion und -integration, was die Effizienz der Datenanalyse um 15% steigerte.

Ausbildung

Universität Hamburg, M.Sc. in Bioinformatik -- Hamburg, Deutschland

Oktober 2016 – September 2018

Technische Universität München, B.Sc. in Molekulare Biotechnologie -- München, Deutschland

Oktober 2013 – September 2016

Fähigkeiten

Programmiersprachen & Tools: Python (Pandas, NumPy, Biopython), R (ggplot2, Bioconductor), Bash, Git, Snakemake, Nextflow

Bioinformatik-Methoden: Genomsequenzierungsanalyse (WGS, WES), RNA-Sequenzierungsanalyse (RNA-Seq, scRNA-Seq), Variantenanalyse, Genexpressionsanalyse, Pathway-Analyse, Phylogenetik

Datenbanken & Cloud: MySQL, PostgreSQL, AWS (S3, EC2), Docker, HPC-Umgebungen

Statistik & Maschinelles Lernen: Statistische Modellierung, Hypothesentest, Clustering, Klassifikation, Dimensionsreduktion

Software & Betriebssysteme: Linux, macOS, Microsoft Office, Jupyter Notebooks

Sprachen: Deutsch (Muttersprache), Englisch (Fließend)