Margaux Mercier

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• E-mail: margaux.mercier@email.com
• Localisation: Genève, Suisse
• LinkedIn: margaux-mercier-bioinfo

Résumé

Quatre ans d'expérience dans l'application de méthodes bioinformatiques pour l'analyse de grands ensembles de données biologiques, avec une expertise particulière en séquençage de nouvelle génération (NGS) et en transcriptomique. A développé et optimisé des pipelines d'analyse pour l'identification de marqueurs génétiques et de voies de signalisation, contribuant à l'avancement de projets de recherche clinique et fondamentale.

Maîtrise des langages de programmation R et Python pour la manipulation et la visualisation de données biologiques complexes. Solide compréhension des principes de la génomique, de la protéomique et de la biologie moléculaire, essentielle pour l'interprétation biologique des résultats obtenus.

Expérience Professionnelle

Technicienne en Bioinformatique, Institut Suisse de Bioinformatique (SIB) -- Genève, Suisse

Janvier 2022 – présent

• Développé et maintenu des pipelines d'analyse bioinformatique pour les données de séquençage de nouvelle génération (NGS), incluant RNA-Seq et WGS, réduisant le temps de traitement des données de 15%.

• Collaboré avec les biologistes pour interpréter les résultats d'analyse, fournissant des visualisations claires et des rapports détaillés sur les données d'expression génique et les variantes génétiques.

• Optimisé des scripts Python et R pour l'automatisation de tâches d'analyse de données, améliorant l'efficacité du laboratoire de 20%.

• Participé à la validation de nouvelles méthodes d'analyse bioinformatique, assurant la robustesse et la reproductibilité des résultats.

Technicienne de Recherche en Bioinformatique, Laboratoire de Génomique Fonctionnelle, Université de Genève -- Genève, Suisse

Mars 2020 – Décembre 2021

• Analyse de données de microarrays et de PCR quantitative pour l'étude de l'expression génique dans des modèles de maladies, identifiant 5 gènes différentiellement exprimés pertinents.

• Utilisé des bases de données biologiques publiques (NCBI, Ensembl, UniProt) pour l'annotation fonctionnelle de gènes et de protéines.

• Préparé des données pour la modélisation statistique et l'apprentissage automatique, supportant des publications scientifiques dans des revues à comité de lecture.

• Maintenu et mis à jour des serveurs de calcul pour l'exécution d'analyses bioinformatiques complexes.

Formation

Université Claude Bernard Lyon 1, Master en Master en Bioinformatique et Biostatistiques -- Lyon, France

Septembre 2018 – Février 2020

Université Savoie Mont Blanc, Licence en Licence en Sciences de la Vie, Parcours Biologie Informatique -- Chambéry, France

Septembre 2015 – Juin 2018

Compétences

Analyse Bioinformatique: Séquençage de nouvelle génération (NGS), RNA-Seq, WGS, Analyse de variants, Génomique comparative, Transcriptomique, Protéomique, Phylogénie, Analyse de microarrays

Programmation et Scripting: R, Python (Biopython, Pandas, NumPy, Matplotlib, Seaborn), Bash, SQL

Outils et Plateformes: Galaxy, BLAST, Bowtie2, BWA, GATK, samtools, bedtools, IGV, Git, Docker, Nextflow

Bases de Données Biologiques: NCBI, Ensembl, UniProt, KEGG, GO, GEO

Statistiques et Visualisation: Statistiques descriptives et inférentielles, Régression, Clustering, Heatmaps, PCA, ggplot2

Langues: Français (Langue maternelle), Anglais (Courant)